让指挥官出来的核心方法是依次完成游戏内特定的主线系列任务。完成名为第二场梦的任务后，你飞船后方一直关闭的门将会解锁，首次见到指挥官并初步获得按5键召唤的能力，但此时指挥官的功能还非常基础。要使指挥官能够自由地走出战甲并独立行动，你需要继续完成下一个核心任务内战，这个任务是对阵双子女皇，完成它后，指挥官才算是真正获得了半解放的状态，可以从战甲中脱离，自由地进行移动、跳跃等基本操作，此时按5键即可在战甲和指挥官形态之间自由切换。
解锁指挥官系统的完整流程需要依次完成三大主线任务，整个过程约需数小时专注剧情推进。首先是完成第二场梦系列任务，这是游戏剧情的一个关键转折点，当洛迪触发时空异常时，需要立即切换指挥官使用虚空射线破解灵煞能量屏障，此阶段指挥官仅能短时闪现攻击，最终在引导下完成脑波同步，解锁指挥官基础召唤功能。接下来需要完成惊惧之心任务，该任务在殁世幽都激活虚空回响装置，操作重点在于指挥官与环境的交互，当装置出现橙色能量波纹时，需用虚空射线持续照射共振点直至装置核心显形。
最终的关键是完成内战任务，它将完全解放指挥官的行动能力。在这个任务中，对抗赤毒守卫时需要采用战甲破盾与指挥官处决交替的战术，先用战甲武器削减敌方护盾，待其跪地僵直时立即召唤指挥官使用虚空射线终结。直面双子女皇时需要注意其弱点机制，当女皇高举权杖蓄力时，绸带会泛起红光，此时全力攻击绸带可中断其强力技能。完成这个任务后，指挥官才能真正实现自由操控。
指挥官功能的完全体解锁通常还需要完成夜羽系列任务，这会开放专精系统。专精系统是指挥官能力的核心，包含五个不同的伟大流派，可以通过它来学习和升级各种强大的虚空能力，例如虚空冲刺和虚空隐匿等，这极大地丰富了指挥官的战术用途。指挥官不仅是一个剧情角色，更具备重要的战斗与探索功能，其能力的成长是持续性的。
在虚空模式下，指挥官可以隐身且无敌，利用这个特性可以在高级地图中安全地操作控制台或拾取关键物品。指挥官的虚空冲刺可以无视敌人碰撞体积并击飞敌人，在拦截任务或快速移动时非常有用。这些能力使得指挥官从战甲中脱离出来不再仅仅是剧情需要，而是成为了玩家战术选择中的重要一环。
